El gran interrogante para los epidemiólogos es dónde y cómo se produjo el contacto inicial con el virus. El hantavirus se transmite generalmente por la inhalación de partículas provenientes de orina o excrementos de roedores infectados.
Dado que Tierra del Fuego ha negado sistemáticamente tener focos activos o registros de la enfermedad, las investigaciones se centran ahora en dos hipótesis, por un lado un contagio previo de los pasajeros en zonas endémicas de la cordillera andina antes de llegar a Ushuaia. Y por otra parte, la presencia accidental de un vector (roedor) dentro de los suministros o la estructura del buque.
El MV Hondius, que transportaba a unos 170 pasajeros y 70 tripulantes, permanece bajo observación internacional mientras se espera que los informes de las autopsias arrojen luz definitiva sobre este luctuoso episodio en el turismo antártico